Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rpusd3Q14AI6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rpusd3Q14AI6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rpusd3Q14AI6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rpusd3Q14AI6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rpusd3Q14AI6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rpusd3Q14AI6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Rpusd3Q14AI6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd3Q14AI6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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