Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rundc1Q0VDN7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms