Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Neurl1bQ0MW30 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms