Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
MitfQ08874 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms