Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cdx4Q07424 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms