Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cntn3Q07409 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cntn3Q07409 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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