Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gdf3Q07104 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gdf3Q07104 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gdf3Q07104 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gdf3Q07104 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms