Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cab39Q06138 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms