Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Thbs3Q05895 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Thbs3Q05895 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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