Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Thbs2Q03350 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms