Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Runx1Q03347 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms