Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxd1Q01822 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms