Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Grin2cQ01098 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Grin2cQ01098 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms