Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms