Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PrcdQ00LT2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms