Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeleQ00690 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SeleQ00690 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SeleQ00690 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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SeleQ00690 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SeleQ00690 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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