Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smarcc1P97496 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms