Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pitx2P97474 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms