Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nkx3-1P97436 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nkx3-1P97436 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nkx3-1P97436 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkx3-1P97436 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nkx3-1P97436 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nkx3-1P97436 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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