Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cbx1P83917 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms