Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irx1P81068 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Irx1P81068 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Irx1P81068 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Irx1P81068 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Irx1P81068 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Irx1P81068 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irx1P81068 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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