Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Otx2P80206 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms