Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usp9xP70398 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms