Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd13P70217 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd13P70217 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms