Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab3cP62823 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms