Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rps29P62274 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rps29P62274 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Rps29P62274 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms