Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CtnsP57757 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CtnsP57757 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms