Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CartptP56388 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CartptP56388 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CartptP56388 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
CartptP56388 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
CartptP56388 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
CartptP56388 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms