Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Defb1P56386 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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