Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PctpP53808 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PctpP53808 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PctpP53808 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms