Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa8P50706 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms