Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
FmodP50608 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
FmodP50608 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
FmodP50608 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms