Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rfx1P48377 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rfx1P48377 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rfx1P48377 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rfx1P48377 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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