Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gli1P47806 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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