Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf4P43488 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf4P43488 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms