Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nkx1-2P42580 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-2P42580 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms