Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp4P35123 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp4P35123 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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