Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprmP28828 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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