Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NapbP28663 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NapbP28663 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms