Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rpl3P27659 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rpl3P27659 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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