Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pde6bP23440 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pde6bP23440 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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