Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ggta1P23336 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms