Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pou3f1P21952 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms