Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SftpcP21841 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms