Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NelfeP19426 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms