Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms