Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps6ka1P18653 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms