Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PtpraP18052 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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