Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hoxb1P17919 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hoxb1P17919 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hoxb1P17919 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Hoxb1P17919 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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