Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms